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基因克隆(Gene cloning)是分子生物學中經(jīng)典的獲取目的基因片段的技術,單克隆陽性率是判定實驗成功的關鍵,百邁客的無縫克隆試劑盒可以在一小時內(nèi)完成定向克隆。詳情咨詢當?shù)劁N售或者后臺留言,我們會有專門的工作人員回復~~1.基因克?。℅ene cloning) 一套完整的流程:

PCR(polymerase chain reaction)擴增目的片段→電泳(electrophoresis)→純化(purification)→連接 (ligase )→轉(zhuǎn)化(transformation)→陽性克隆(positive clone)→檢測(detection)

圖1:無縫克隆流程圖(圖片來源于網(wǎng)絡)

2. PCR擴增:選擇要擴增的目的片段,在正義鏈和反義鏈的末端分別設計一條帶有線性化載體正義鏈和反義鏈部分同源序列一致的引物,此處參考說明書建議(15-25bp)。為了減少非特異性擴增,建議與靶序列的匹配度越高越好。

3.電泳:PCR結果的好壞通常通過瓊脂糖凝膠電泳來觀察條帶有無或者濃度大小,基本原理是瓊脂糖凝膠介質(zhì)中添加了在紫外下可以顯色的EB, 這種試劑可以嵌合到核酸分子中,與DNA雙鏈結合,因此,分子量越大的DNA分子,顯色度越高,在相同濃度下也越亮。有的時候如果分子量很小的DNA, 濃度又不高的情況下,DNA條帶有可能會出現(xiàn)假陰性的結果。

4.目的片段的純化(膠回收):PCR擴增結束后,體系中可能會有未參與反應的聚合酶,Mg2+等,所以一般是建議通過純化的步驟將這些雜質(zhì)去除,以利于后續(xù)反應的穩(wěn)定進行。

載體線性化:目的片段插入需要將環(huán)狀的質(zhì)粒用酶來消化成線性的雙鏈DNA分子,實際情況下載體消化會因為反應時間和酶量多少而有較大區(qū)別,如果用于后續(xù)的基因克隆,建議消化盡量完全。

5.連接反應:Biomarker MultiF Seamless Assembly Mix試劑盒可以將多個片段組合到載體上,形成一個環(huán)狀的重組質(zhì)粒。用于后續(xù)的建庫測序或者誘導蛋白表達。

6.轉(zhuǎn)化:基本原理是質(zhì)粒容易在大腸桿菌中穩(wěn)定繁殖,這部分是基因克隆的關鍵,如果成功,后續(xù)的平板上會有單克隆的出現(xiàn)。有單克隆出現(xiàn)可以進行下一步實驗。單克隆平板可以在4 ℃冰箱存放一個月,仍然不失效。

7.檢測:挑取帶有抗生素平板單克隆擴大培養(yǎng),3-4 h, 使質(zhì)??截悢?shù)增加,隨后用于菌落PCR檢測,是否是插入了目標片段的質(zhì)粒。

小貼士

其他判斷陽性單克隆的方法?

最可靠的方法是酶切,一個環(huán)狀重組質(zhì)粒,在對應的位置用限制性內(nèi)切酶雙酶切后,會出現(xiàn)兩個目的片段,如果不能出現(xiàn)兩個片段,一般可以認為是空載體沒有線性消化完全。

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結果展示

圖2:單克隆檢測示意圖

結果分析

攜帶有目的片段的質(zhì)粒能夠抵抗抗生素,才使得在平板培養(yǎng)基上長出來。但也有可能是沒有消化完全的空質(zhì)粒。因此,下一步的鑒定實驗顯得尤為重要。菌落PCR在分子生物學實驗中,容易有假陽性出現(xiàn),可能的原因很多,因此,最根本的方法就是提高陽性率。以質(zhì)粒為模板擴增,產(chǎn)物濃度會很高,可作為判定假陽性的一個依據(jù)。以及上述所提及的質(zhì)粒的酶切,都是最常用的方法。

保存條件

置于–20°C保存,完全解凍并搖勻,置于冰上備用,使用過程中避免反復凍融。

產(chǎn)品應用

快速克隆
高通量克隆無縫克隆

DNA定點突變

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