生信零基礎(chǔ)，如何進(jìn)行代謝組學(xué)生信分析？

還記得3月6日驚蟄，百邁客發(fā)生的大事件嗎？沒錯(cuò)，為了幫助廣大科研工作者獲得更準(zhǔn)確的檢測數(shù)據(jù)，百邁客強(qiáng)勢引進(jìn)Waters UPLC I class PLUS 及Xevo G2-XS QTOF，同時(shí)全面上線代謝組云分析工具，極速縮短分析周期，提升個(gè)性化數(shù)據(jù)挖掘空間。

那么今天來嘮一嘮全面上線的代謝組云分析平臺，該平臺優(yōu)勢在于生信零基礎(chǔ)的科研小伙伴，也能快速進(jìn)行代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析哦，閑話不說，來來來，聽大神絮叨一會，小白也能秒變大神呢，come，on！

代謝組云分析平臺是什么？

百邁客云提供專業(yè)的生信分析平臺（http://www.biocloud.net/），新上線的代謝組云APP兼具標(biāo)準(zhǔn)分析、聯(lián)合分析和個(gè)性化分析功能，同時(shí)海量在線資源以供學(xué)習(xí)和使用。

代謝組APP如何使用？

首先，您需要登錄到百邁客云平臺網(wǎng)址（http://www.biocloud.net/），點(diǎn)擊全部導(dǎo)航->分析->農(nóng)學(xué)

在農(nóng)學(xué)分析各平臺右側(cè)選擇代謝組分析平臺，如下圖：

點(diǎn)擊，選擇打開軟件

打開軟件之后，代謝組信息分析開始了，首先輸入項(xiàng)目名稱，用于區(qū)分不同的分析項(xiàng)目。

正式分析開始了哦，總共分3步：

第一步

在代謝定量文件中導(dǎo)入質(zhì)譜檢測得到的代謝物的定量文件

?

文件的格式如下：

注：第一列為代謝物ID，第二列為代謝物定性名稱，第三列至最后為各個(gè)樣本的定量信息。

第二步

綜合選項(xiàng)選擇，包括注釋物種分類、分析報(bào)告名稱、物種名、歸一化方式等

 

KEGG注釋分類：根據(jù)我們所分析的物種選擇相對應(yīng)的分類。這樣方便我們得到更準(zhǔn)確的注釋結(jié)果。

歸一化方式：對我們的定量結(jié)果進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化的方式。如果我們自己已經(jīng)做過歸一化，那么選擇否就可以。

第三步

設(shè)置差異分析的條件：包括差異倍數(shù)、T檢驗(yàn)p值、VIP值、以及差異分組

在進(jìn)行分組設(shè)置時(shí)，我們可以自由添加分組，設(shè)置自己的組名，并在組名之后添加用于差異分析的樣品。

最后點(diǎn)擊提交，半個(gè)小時(shí)即可輕松完成12項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)分析內(nèi)容啦！剩下的就是坐等分析結(jié)果嘍～

當(dāng)然除了以上標(biāo)準(zhǔn)分析，云平臺可以進(jìn)行深入的個(gè)性化分析以及多組學(xué)聯(lián)合分析（代謝組和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合、代謝組和微生物聯(lián)合），有木有很期待，掃描以下二維碼報(bào)名，下期大神教小白如何進(jìn)行個(gè)性化和聯(lián)合分析哦。