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近年來,隨著測序技術的不斷升級,測序通量越來越高,同時測序成本直線下降,高通量測序技術逐漸應用在科研、醫(yī)療等各個研究領域得到廣泛應用。伴隨著大數(shù)據(jù)處理關鍵技術的突破、數(shù)據(jù)共享等契機的發(fā)展,大數(shù)據(jù)將在促進生物學發(fā)展中發(fā)揮重要的作用,同時生物信息學也發(fā)展為當今最具發(fā)展前途的學科之一。

生物信息學自產(chǎn)生以來,大致經(jīng)歷了三個發(fā)展階段:前基因組時代、基因組時代和后基因組時代。前基因組時代的標志性工作包括生物數(shù)據(jù)庫的建立、檢索工具的開發(fā)以及DNA和蛋白質(zhì)序列分析等;基因組時代的標志性工作包括基因識別與發(fā)現(xiàn)、網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫的建立和交互界面工具的開發(fā)等;后基因組時代的研究重點主要體現(xiàn)在基因組學(genomics)、比較基因組學(Comparative genomics)和蛋白質(zhì)組學(Proteomics)等方面,標志則是大規(guī)?;蚪M分析、從核酸和蛋白質(zhì)序列、表達譜數(shù)據(jù)出發(fā),分析序列中表達的結構與功能、基因調(diào)控網(wǎng)絡、生化代謝途徑的生物信息。這三個階段雖無明顯的界限,但反映出整個研究中信的轉(zhuǎn)移變化情況。

目前,生物信息學的主要研究內(nèi)容已經(jīng)從DNA和蛋白質(zhì)序列比較、編碼區(qū)分析、分子進化轉(zhuǎn)移到大規(guī)模的數(shù)據(jù)整合、可視化;轉(zhuǎn)移到比較基因組學、代謝網(wǎng)絡互作分析、基因表達網(wǎng)絡互作分析,蛋白質(zhì)結構與功能分析以及藥物靶點篩選等,后基因組時代是生物信息學與功能基因組、蛋白質(zhì)組、結構基因組等領域的結合。

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