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 分類: 基因組測(cè)序

ITS 測(cè)序含義:ITS 是 internal transcribed spacer 的縮寫,內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)。

真核生物 rRNA 順反子作為一個(gè)轉(zhuǎn)錄單元,包含 18S、5.8S 和 28S rRNA。轉(zhuǎn)錄后的剪接加工過程,會(huì)移除兩個(gè)內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)和 5.8SrRNA ,這兩個(gè)內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)和 5.8SrRNA 統(tǒng)稱為 ITS 區(qū)。通常 18S rRN是作為真核生物分子鑒定的標(biāo)準(zhǔn),但是 ITS 區(qū)在真菌分類里更加準(zhǔn)確,要優(yōu)于使用 18SrRNA作為標(biāo)準(zhǔn)得到的結(jié)果。

ITS1 和 ITS2 作為非編碼區(qū),承受的選擇壓力較小,相對(duì)變化較大,并且能夠提供詳盡的系統(tǒng)學(xué)分析所需要的可遺傳性狀。最近的研究發(fā)現(xiàn),ITS1 比 ITS2 效率更高、引物適用性更普遍和廣泛,此外 ITS1 的擴(kuò)增片段更短、GC 含量更低,因此 ITS1 可能更優(yōu)于 ITS2。

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