單細(xì)胞免疫組庫

免疫組庫（Immune Repertoire，IR）是B/T淋巴細(xì)胞抗原受體多樣性檢測(cè)，即BCR/TCR的多樣性。BCR和TCR一般由可變區(qū)(V區(qū))、多變區(qū)(D區(qū))、連接區(qū)(J區(qū))、恒定區(qū)(C區(qū))構(gòu)成, V(D)J區(qū)域在遺傳過程中發(fā)生重排或重組，形成大量不同的組合形式，導(dǎo)致BCR和TCR基因序列多樣性極其豐富，這些序列多樣性集合稱為免疫組庫。

單細(xì)胞免疫組庫測(cè)序（scVDJ-seq ）是基于10x Genomics平臺(tái)的微流控和油滴包裹技術(shù)，在單細(xì)胞水平同時(shí)檢測(cè)轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)和TCR/BCR多樣性，不但可以了解TCR/BCR克隆型，還可以聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)深入挖掘生命機(jī)理，為免疫組學(xué)研究提供更高效的平臺(tái)，在腫瘤微環(huán)境、感染性疾病、自身免疫疾病等研究領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用前景。

利用10× Genomics平臺(tái)完成單細(xì)胞的分離、反轉(zhuǎn)錄成cDNA后，將cDNA一分為二，同時(shí)進(jìn)行TCR/BCR的V(D)J建庫和5’單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄本建庫，并連接測(cè)序引物，獲得每個(gè)細(xì)胞5’基因表達(dá)數(shù)據(jù)和V(D)J全長(zhǎng)序列信息，獲得數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)胞亞群聚類、細(xì)胞表達(dá)特征、標(biāo)記分子篩選、免疫組庫克隆型等分析。

百邁客推出10x genomics 單細(xì)胞免疫組庫升級(jí)版2.0，使用chipK芯片和dual index，全新體驗(yàn)，性能更優(yōu)。

高通量

基于10x Genomics單細(xì)胞捕獲平臺(tái)可實(shí)現(xiàn)上萬個(gè)細(xì)胞的免疫組庫多樣性檢測(cè)

高分辨率

可獲得真正單細(xì)胞水平的的免疫組庫信息

信息全面

擴(kuò)增區(qū)域是V(D)J全長(zhǎng)基因序列，獲取免疫組庫多樣性更全面

雙鏈準(zhǔn)確匹配

單細(xì)胞水平可高效匹配BCR的重鏈和輕鏈以及TCR的α鏈和β鏈

單細(xì)胞表達(dá)

同時(shí)測(cè)定同一細(xì)胞匹配的免疫組庫（TCR/BCR）信息和5’基因表達(dá)

經(jīng)驗(yàn)豐富

累計(jì)制備100余種組織類型、3000+例的單細(xì)胞樣本

強(qiáng)大生信分析

實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞免疫組庫和基因表達(dá)聯(lián)合分析，挖掘更多的細(xì)胞互作，提供個(gè)性化分析

乳腺腫瘤微環(huán)境中多種免疫表型的單細(xì)胞圖譜

了解腫瘤微環(huán)境中免疫細(xì)胞的表型，對(duì)于癌癥進(jìn)展和免疫治療反應(yīng)的研究至關(guān)重要。研究者使用單細(xì)胞RNA測(cè)序分析了來自8位原發(fā)性乳腺癌患者的45,000個(gè)免疫細(xì)胞，觀察到正常免疫細(xì)胞與腫瘤組織中免疫細(xì)胞之間有顯著相似性，但后者針對(duì)腫瘤微環(huán)境出現(xiàn)特異性連續(xù)表型擴(kuò)展；并通過單細(xì)胞免疫組庫測(cè)序檢測(cè)另外27,000個(gè)T細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)和T細(xì)胞受體（TCR）多樣性，結(jié)果揭示了TCR組合使用對(duì)表型多樣性的影響。單細(xì)胞免疫組庫和單細(xì)胞RNA數(shù)據(jù)聯(lián)合分析更有利于研究腫瘤微環(huán)境、尋找免疫治療的靶點(diǎn)，輔助腫瘤診療。

• Nature Medicine | 單細(xì)胞免疫組庫揭示潰瘍性結(jié)腸炎中結(jié)腸T細(xì)胞圖譜
• Science |單細(xì)胞+T細(xì)胞免疫組揭示胸腺細(xì)胞的發(fā)育軌跡